František Cipro dovedl fotbalovou Slavii k ligovému titulu a do semifinále Poháru UEFA, už jako hráč za ni nastřílel 41 gólů. Nyní již dlouhá léta prožívá góly svých svěřenců jako fotbalový trenér.

V minulosti byl také aktivním hráčem, který největší část své kariéry spojil se Slavií Praha. Hrál na postu záložníka, jeho hru charakterizovala rychlost. V lize nastoupil za Slavii k 232 utkáním a vstřelil 41 branek.Po skončení aktivní hráčské kariéry se stal trenérem.

Hned na jedné z prvních trenérských pozic si připsal úspěch, když dokázal v sezóně 1988/89 dovést Zbrojovku Brno z druhé ligy zpět do nejvyšší soutěže. Tým poté trénoval ještě jednu sezónu a poté odešel trénovat na Kypr klub AEL Limassol. Po dvou letech se vrátil do České republiky a převzal tým Chmel Blšany.

Největších úspěchů však dosáhl se Slavií Praha. V létě 1995 vystřídal na postu hlavního trenéra Slavie Miroslava Beránka a dovedl klub v sezóně 1995/96 k mistrovskému titulu. Navíc na jaře 1996 klub pod jeho vedením došel až do semifinále poháru UEFA, když dokázal vyřadit například AS Řím. V semifinále podlehla Slavia Girondins Bordeaux. O rok později odešel trénovat rakouský tým Tirol Innsbruck. Do Slavie se poté vrátil ještě na sezónu 1999/2000.

V dalších letech působil na postu hlavního trenéra v dalších českých prvoligových klubech - v Teplicích, Plzni a Českých Budějovicích. Působil také jako hlavní skaut SK Slavia Praha. Po propuštění Karla Jarolíma převzal funkci hlavního trenéra, kde působil do konce sezony 2009/10. V sezóně 2011/12 se po pátém kole stal novým trenérem Českých Budějovic a nahradil Jiřího Kotrbu. V březnu 2015 se stal znovu trenérem Českých Budějovic.